Visi tersebut di atas dijabarkan kedalam misi Fakultas Kesehatan Masyarakat Universitas Jember sebagai berikut:

• Menyelenggarakan pendidikan kesehatan masyarakat berbasis agro-coastal community yang berwawasan lingkungan.
• Melaksanakan penelitian dan pengabdian kesehatan masyarakat berbasis agro-coastal community yang berwawasan lingkungan.
• Menata dan mengembangkan manajemen kelembagaan fakultas berbasis teknologi informasi.
• Membina dan mengembangkan jaringan kerjasama dengan lembaga terkait untuk meningkatkan derajat kesehatan Masyarakat ditingkat lokal, nasional dan internasional.

Tujuan FKM UNEJ Menghasilkan lulusan Sarjana Kesehatan Masyarakat (S.KM.), Sarjana Gizi (S.Gz.) dan Magister Administrasi Kesehatan (M.Kes.) dengan kualifikasi:

• Menghasilkan lulusan yang berkualitas, professional berbasis agro-coastal community, berwawasan lingkungan yang berkarakter dan berjiwa entrepreneur.
• Menghasilkan tridharma perguruan tinggi yang berwawasan lingkungan dan berbasis agro-coastal community.
• Mewujudkan sistem manajemen fakultas yang berkualitas (transparan dan akuntabel) dan berbasis teknologi informasi.
• Terjalinnya jaringan kerjasama dengan lembaga terkait untuk meningkatkan derajat kesehatan masyarakat ditingkat lokal, nasional dan internasional.

Tujuan strategis selanjutnya perlu dijabarkan secara spesifik dan terukur dalam sasaran strategis yang dapat dijadikan prioritas pengembangan untuk menyelesaikan masalah dalam jangka pendek. Sasaran tersebut antara lain:

• Peningkatan lulusan yang berkualitas, professional berbasis agro-coastal community, berwawasan lingkungan yang berkarakter dan berjiwa entrepreneur.
• Peningkatan sistem manajemen fakultas yang berkualitas (transparan dan akuntabel) dan berbasis teknologi informasi;
• Peningkatan tri dharma perguruan tinggi yang berwawasan lingkungan dan berbasis agro-coastal community.
• Peningkatan jaringan kerjasama dengan lembaga terkait untuk meningkatkan derajat kesehatan masyarakat ditingkat lokal, nasional dan internasional.